El estándar IFS Food certifica que la empresa ha adoptado los objetivos de satisfacer plenamente las obligaciones legislativas y proteger al consumidor ofreciendo «productos seguros, conformes a las especificaciones contractuales y los requisitos establecidos por la ley». Agotzaina SL ha obtenido la certificación de nivel «Higher», que «representa la «best practice» de la industria alimenticia».

Agtozania S.L. está certificada por el Consorcio para el Control de los Productos Biológicos (CCPB), que inspecciona directamente los criaderos y los centros de elaboración. La certificación confirma la aplicación, por parte de la empresa, de lo dispuesto por el Reg. CE 834/2007 correspondiente a la producción biológica.

Protocolo para la certificación de sistemas de autocontrol específicos para la exportación a países terceros con requisitos diferentes a los intracomunitarios en el ámbito del real decreto 993/2014 por el que se establece el procedimiento y los requisitos de la certificación veterinaria oficial para la exportación.

La certificación Kosher confirma la idoneidad de los alimentos para ser consumidos por la comunidad judía, puesto que son producidos en base a las reglas alimentarias establecidas en la «Torah».